HAL archives ouvertes vs theses.fr : quel dépôt privilégier ?

Votre soutenance approche — ou vient tout juste de se terminer — et vous vous retrouvez face à une question que personne n’a vraiment anticipée dans votre formation doctorale : dois-je déposer sur HAL, sur theses.fr, ou les deux à la fois ? La réponse semble technique, presque administrative. Pourtant, ce choix conditionne la visibilité internationale de vos travaux, le respect de vos obligations légales et, dans certains cas, l’obtention définitive de votre grade de docteur.

Ce que la plupart des doctorants ignorent : ces deux plateformes ne sont pas des concurrentes. Elles répondent à des logiques institutionnelles différentes, s’inscrivent dans des cadres réglementaires distincts et servent des publics partiellement disjoints. Confondre leurs fonctions, c’est risquer des doublons mal gérés, des embargos mal configurés ou une visibilité amputée.

Définitions : ce que sont vraiment HAL et theses.fr

Avant toute comparaison, il faut poser les bases — et elles sont moins évidentes qu’il n’y paraît.

HAL archives ouvertes : une infrastructure de diffusion scientifique

HAL (Hyper Articles en Ligne) est une archive ouverte nationale créée en 2001 par le Centre pour la Communication Scientifique Directe (CCSD), unité propre du CNRS. Sa vocation première est la diffusion en accès libre du texte intégral des travaux scientifiques : articles de revues, communications, rapports, mais aussi thèses et mémoires. Fin 2023, HAL héberge plus de 1,5 million de documents en texte intégral.

Ce qui distingue HAL structurellement, c’est son architecture distribuée : chaque établissement peut disposer de son portail HAL propre (HAL-Sorbonne, HAL AMU, HAL Université de Lorraine…), alimenté par le même référentiel central. Le dépôt est ouvert à tout chercheur affilié à un établissement d’enseignement supérieur ou de recherche français.

theses.fr : le portail national de signalement des thèses

theses.fr est géré par l’Agence Bibliographique de l’Enseignement Supérieur (ABES). Sa mission est différente : signaler (référencer les métadonnées), certifier (attester la soutenance) et archiver pérennement les thèses françaises. C’est un registre national, pas simplement un entrepôt de fichiers.

Le circuit passe par le logiciel STAR (Signalement des Thèses et Archivage) pour les thèses soutenues, et STEP (Signalement des Thèses En Préparation) pour les thèses en cours. Toute thèse soutenue en France doit, par obligation légale, être signalée via ce circuit — qu’un texte intégral soit accessible ou non.

Les différences fondamentales entre les deux plateformes

Voici où la méthodologie de recherche et les normes de citation françaises entrent directement en jeu : chaque plateforme impose ses propres standards de description bibliographique et ses propres règles de validation.

Ce tableau illustre une réalité que beaucoup de doctorants découvrent trop tard : si theses.fr certifie votre grade, HAL amplifie votre visibilité. Négliger l’un ou l’autre, c’est jouer à moitié.

L’interopérabilité technique : un enjeu sous-estimé

HAL est moissonnée par OpenAIRE (portail européen de la science ouverte) et s’interconnecte avec ORCID pour l’identification des auteurs. theses.fr alimente le Sudoc (catalogue collectif français) et DART-Europe (portail des thèses européennes). Ces chaînes d’interopérabilité déterminent où vos travaux apparaîtront dans les moteurs de recherche académiques — Google Scholar, BASE, Core.ac.uk.

Obligations légales de dépôt : ce que dit la réglementation

C’est le point que personne ne lit vraiment — et c’est pourtant là que se jouent des situations concrètes de blocage administratif.

L’arrêté du 25 mai 2016 relatif à la formation doctorale (article 24) impose le dépôt de la thèse sous forme numérique dans les établissements de soutenance, qui transmettent ensuite le fichier à l’ABES via STAR. Le texte intégral est rendu accessible — sauf décision contraire du jury motivée par des raisons de confidentialité.

Le Deuxième Plan national pour la science ouverte 2021-2024 est allé plus loin : il fixe l’objectif de 100 % de publications de la recherche publique française en accès ouvert, avec HAL comme infrastructure privilégiée. Concrètement, de nombreux établissements ont intégré dans leur règlement doctoral une obligation de dépôt dans HAL en plus de STAR.

Pour une analyse approfondie des obligations légales qui s’appliquent spécifiquement à votre situation, l’article sur la science ouverte et les obligations légales pour thèses en 2025 détaille les textes de référence et leur application par établissement.

Le cas des thèses sous confidentialité

Une thèse réalisée en partenariat industriel (CIFRE, par exemple) peut faire l’objet d’une demande de confidentialité totale pendant une durée maximale de 10 ans. Dans ce cas, theses.fr conserve les métadonnées (titre, auteur, résumé, NNT), mais le texte intégral n’est pas accessible au public. HAL peut également héberger le document avec embargo prolongé. Cette configuration mérite d’être anticipée dès la rédaction du contrat doctoral.

Critères pour choisir votre plateforme de dépôt

Posons la vraie question : si vous ne pouviez déposer que sur une seule plateforme (ce qui n’est presque jamais le cas, mais supposons), laquelle choisiriez-vous ? La réponse dépend de trois paramètres.

1. Votre objectif principal : certification ou diffusion ?

Si votre priorité est d’obtenir votre diplôme et de respecter le cadre légal français, theses.fr (via STAR) est non négociable. Le NNT (Numéro National de Thèse) est l’identifiant qui atteste officiellement votre grade de docteur. Sans ce dépôt, la délivrance du diplôme peut être bloquée.

Si votre priorité est la visibilité internationale de vos travaux — citations par la communauté académique mondiale, indexation dans Google Scholar, présence dans OpenAIRE — HAL est plus puissant. Son intégration dans les réseaux européens d’archives ouvertes lui confère une portée que theses.fr n’a pas vocation à atteindre.

2. La politique de votre établissement

Certains établissements ont signé des accords de type “HAL-X” et imposent le dépôt dans le portail HAL institutionnel. D’autres délèguent entièrement à STAR et n’exigent pas de dépôt HAL séparé. Vérifiez le règlement doctoral de votre école doctorale — c’est le document de référence, pas les rumeurs de couloir.

3. La nature de votre document

theses.fr est exclusivement réservé aux thèses de doctorat françaises. HAL accepte une palette bien plus large : thèses de master, HDR (Habilitation à Diriger des Recherches), articles, chapitres d’ouvrages, jeux de données. Si vous voulez centraliser l’ensemble de vos productions scientifiques sur un profil unique, HAL offre cette cohérence.

Guide pratique : déposer sur HAL et theses.fr étape par étape

Voici ce que personne ne vous dit clairement dans les tutoriels officiels : les deux processus sont techniquement distincts, mais peuvent se rejoindre selon la configuration de votre établissement.

Déposer sur theses.fr via STAR

1. Préparer le fichier PDF/A — Le format exigé est PDF/A (archive), validé par le service FACILE du CINES. Ce n’est pas un PDF ordinaire : les polices doivent être intégrées, les liens actifs, les métadonnées XMP renseignées.
2. Saisir les métadonnées dans STAR — Titre, résumé en français et en anglais, mots-clés (au minimum en deux langues), discipline, directeur de thèse, membres du jury. La qualité de ces métadonnées détermine votre indexabilité dans le Sudoc et dans les moteurs de recherche académiques.
3. Validation par l’établissement — Le service de scolarité ou la bibliothèque universitaire vérifie la conformité du dossier. L’ABES détaille les contrôles de validation dans la documentation ThèsesPro.
4. Attribution du NNT — Une fois validé, l’ABES attribue le Numéro National de Thèse. C’est ce numéro que vous citez dans votre CV et dans les demandes de dérogation.
5. Mise en ligne sur theses.fr — Le délai entre validation et publication varie entre 24h et quelques semaines selon les établissements et le volume de dossiers.

Déposer sur HAL archives ouvertes

1. Créer ou vérifier votre compte HAL — Si vous avez un ORCID, liez-le immédiatement à votre profil HAL. Cette association automatisera le renseignement de vos affiliations.
2. Choisir le type de document — Sélectionnez “Thèse” dans le formulaire de dépôt. La documentation officielle HAL détaille chaque champ du formulaire.
3. Déposer le fichier et renseigner les métadonnées — HAL accepte plusieurs formats. Renseignez le résumé structuré, les mots-clés (idéalement issus d’un thésaurus comme MeSH pour les sciences de la santé ou Rameau pour les sciences humaines), et l’identifiant HAL de votre directeur de thèse.
4. Configurer les droits d’accès — Accès immédiat, embargo temporaire ou accès restreint. Si votre thèse est sous confidentialité partielle, l’embargo peut être paramétré chapitre par chapitre.
5. Validation et modération — L’équipe HAL vérifie la conformité du dépôt. Des tutoriels vidéo sont disponibles sur le wiki CCSD pour accompagner chaque étape.

Pour un guide pas-à-pas encore plus détaillé, avec captures d’écran et recommandations spécifiques par établissement, consultez le guide complet 2025 sur le dépôt de thèse sur HAL et theses.fr.

Normes de citation et métadonnées : les exigences de chaque plateforme

C’est ici que la méthodologie de recherche et les normes de citation (France) deviennent concrètes. Une thèse mal décrite bibliographiquement n’existe presque pas pour les moteurs de recherche académiques.

Le standard de métadonnées Dublin Core dans HAL

HAL repose sur le Dublin Core qualifié et sur le protocole OAI-PMH pour l’interopérabilité. Chaque dépôt génère automatiquement une fiche de métadonnées exportable en formats XML, BibTeX, RIS, EndNote. Si vous utilisez Zotero (et vous devriez), HAL est directement compatible avec le connecteur Zotero — une thèse déposée sur HAL s’importe en un clic dans votre bibliothèque de références.

La gestion des références bibliographiques est d’ailleurs l’une des compétences les plus mal maîtrisées par les doctorants — et les erreurs de métadonnées dans HAL ou STAR en sont souvent la cause directe.

L’identifiant NNT : la référence bibliographique de votre thèse

Quand quelqu’un cite votre thèse dans un article académique, le NNT est l’identifiant de référence. Il s’écrit sous la forme : ANNÉEÉTABLISSEMENTNNNN (ex. : 2024PARI0042). Ce code doit figurer dans les métadonnées HAL si vous y déposez également votre thèse, pour assurer le lien entre les deux référentiels.

La question du format : PDF/A pour l’archivage pérenne

theses.fr exige un PDF/A validé FACILE — et ce n’est pas une formalité. L’archivage pérenne au CINES (Centre Informatique National de l’Enseignement Supérieur) garantit que votre thèse restera lisible dans 50 ans, indépendamment des évolutions technologiques. Un PDF ordinaire, avec des polices non intégrées ou des scripts JavaScript, sera refusé par le validateur. Anticipez cette contrainte lors de la compilation finale, que vous travailliez sous Word, LaTeX ou LibreOffice.

Pour ceux qui rédigent sous LaTeX, la chaîne LaTeX → PDF/A est bien documentée, notamment dans les ressources pédagogiques de Martin Vérot sur la bibliographie avec Zotero sous LaTeX — une référence dans la communauté des doctorants francophones.

Mots-clés et thésaurus : un choix stratégique

Ce point est systématiquement sous-estimé. Les mots-clés que vous renseignez dans STAR et HAL déterminent dans quelles listes de résultats votre thèse apparaîtra. Privilégiez des termes issus de thésaurus reconnus (Rameau, MeSH, Eurovoc selon votre discipline) plutôt que des termes libres inventés. Une thèse en sciences de l’éducation indexée avec “apprentissage” (terme générique) sera nettement moins visible que la même thèse indexée avec “apprentissage par problèmes — enseignement supérieur” (descripteur Rameau normalisé).

Questions fréquentes sur HAL archives ouvertes et theses.fr

Synthèse : adopter une stratégie de dépôt cohérente

HAL archives ouvertes et theses.fr ne s’opposent pas — ils se complètent. theses.fr certifie votre identité de docteur ; HAL projette vos travaux dans la communauté scientifique mondiale. La bonne stratégie, pour la quasi-totalité des doctorants français, est de mener les deux dépôts en parallèle, avec une attention particulière à la qualité des métadonnées et à la conformité des formats.

Ce qui fait réellement la différence, c’est l’anticipation. Un fichier PDF/A mal préparé peut retarder votre dépôt STAR de plusieurs semaines. Des mots-clés génériques dans HAL peuvent réduire de moitié votre visibilité dans les moteurs de recherche académiques. Des métadonnées incohérentes entre les deux plateformes créent des doublons difficiles à corriger après coup.

La méthodologie de recherche et les normes de citation françaises imposent une rigueur documentaire qui s’applique aussi — et surtout — au moment du dépôt de vos propres travaux.

Article mis à jour en 2025. Sources principales : arrêté du 25 mai 2016 relatif à la formation doctorale (JORF), Baromètre français de la Science Ouverte 2023 (Ministère MESR), Plan national pour la science ouverte 2021-2024 (Ministère MESR/Ouvrir la Science), documentation officielle ABES (ThèsesPro) et CCSD (HAL).